Variabilidad genética del germoplasma de algunas especies de los géneros Carica y Vasconcellea (Caricaceae) con el uso de marcadores RAPD

Abstract

La lechosa constituye un cultivo de importancia económica en Venezuela. La conservación de genotipos en colecciones de germoplasma requiere un buen manejo de la diversidad genética, aspecto que puede lograrse eficientemente con técnicas moleculares. En el presente trabajo se realizó la caracterización molecular de 73 accesiones de dos géneros de Caricaceae (Carica y Vasconcellea) conservadas en campo y colectadas de las zonas centro occidental y oriental del país, empleando la técnica RAPD. La evaluación molecular se realizó usando un análisis de conglomerados (Ward) basado en la distancia de disimilitud de Jaccard y un análisis de coordenadas principales(ACP). Se evaluaron seis combinaciones de iniciadores para la amplificación selectiva, las cuales amplificaron un total de 90 bandas con 100% de polimorfismo. Los cebadores OPC 2, OPC 5 y OPA 9 lograron establecer altos niveles de variabilidad entre los dos géneros, evidenciándose la conformación de grupos claramente separados. El ACP apoya los resultados obtenidos por el análisis de conglomerados y ayudó a diferenciar claramente a Carica de Vasconcellea. También se encontraron patrones de bandas únicas, que permitieron diferenciar los dos géneros. Los resultados indican la existencia de una alta diversidad genética entre las accesiones de Caricaceae estudiadas.

ABSTRACT

The papaya is an important crop in Venezuela. The conservation of genotypes in germplasm collections requires good management of genetic diversity. This aspect that can be achieved efficiently with molecular techniques. In this paper, molecular characterization of 73 accessions of Caricaceae preserved in the field and collected from the western and eastern central areas of the country was carried out through RAPD technique. The assessment was studied using molecular cluster analysis (Ward) based on the Jaccard dissimilarity distance and principal coordinate analysis. Using six primers combinations, 90 bands with a 100% of polymorphism were obtained. The primers OPC2, OPC5, and OPA9 managed to establish high levels of variability between the two genera, showing the formation of clearly separated groups. The principal coordinate analisys supports the results obtained from cluster analysis and clearly discriminate Carica and Vasconcellea. We also found unique banding patterns, which allow to differentiate the two genera studied. The results showed the existence of high genetic diversity among Caricacea accessions.