Ligand based pharmacophore model for Genistein analogs, phytoestrogen with selectivity for the estrogen ß receptor

Resumen

Se obtuvo un modelo de farmacóforo tridimensional utilizando un grupo de Fitoestrógenos con selectividad por elre ceptor estrogénico ß y una combinación de técnicas de acoplamiento (docking) en el receptor y diseño de far -macó foro en base a ligandos. Como referencia se utilizó un complejo cristalino de Genisteina (1) con el receptor es -trogénico ß reportado en la Base de Datos de Proteínas de Brookhaven (1QKM). Los compuestos estudiados fuerondivididos en grupo de ensayo y grupo de validación. Para el estudio de acoplamiento (docking) preliminar se utilizóel programa Scigress 7.0 y los resultados fueron utilizados para escoger los compuestos del grupo de ensayo. Se ge -ne raron los modelos de farmacóforo utilizando el modulo GALAHAD del programa Sybyl 8.0. La mejor hipótesis fueidentificada por el mayor consenso entre las características del farmacóforo y la parte estérica, y adicionalmente unabaja energía; este modelo presenta tres zonas hidrofóbicas y tres zonas aceptoras de protones. Los compuestos másselectivos del grupo de validación, compuestos estructuralmente diversos, presentaron una buena alineación conlas características del farmacóforo propuesto. Estos estudios demuestran la aplicabilidad de la combinación de técnicasde acoplamiento con la generación de farmacóforo para identificar compuestos más selectivos. Estos métodos«in silico» también podrían ser de utilidad para el diseño racional de nuevos compuestos con selectividad poreste receptor.