Caracterización molecular de accesiones de ají (Capsicum spp.) utilizando marcadores de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD) Molecular characterization of pepper accessions (Capsicum spp.) using randomly amplified polymorphic DNA markers (RAPD)

Resumen

La alta variabilidad genética existente en ají dulce hace necesaria la obtención de un material homogéneo, tanto agronómico como culinario, y la caracterización molecular facilita el estudio de la diversidad genética entre materiales que puedan ser incluidos en los programas de mejoramiento genético. El objetivo del presente estudio fue caracterizar molecularmente 12 accesiones de ají del Banco de Germoplasma del INIA-CENIAP mediante 12 marcadores RAPD. Se utilizó tejido foliar para la extracción de ADN y la separación de los productos PCR-RAPD fue en geles de agarosa 1,5%. La mejor resolución para evaluar la variabilidad y el polimorfismo genético entre las accesiones, se observó en los cebadores OPA 02, OPE 03 y OPE 04. Se generaron 39 fragmentos, de los cuales 27 fueron polimórficos (69,23%). La matriz de presencia y ausencia permitió calcular porcentaje de polimorfismo, PIC y realizar el análisis multivariado de conglomerados jerárquicos UPGMA (dendrograma), utilizando la distancia Jaccard. Los valores de similitud entre los genotipos estudiados oscilaron entre 0,00 y 0,77. El OPE 03 aportó la mayor información polimórfica (78,57%) y PIC = 0,34. El análisis UPGMA generó dos grupos discriminantes, el Grupo I y distancia de similitud de 0,20; las accesiones: OSP-HOR-10-988, OSP-HOR-10-399, OSP-HOR-14-981 (ajíes dulces), OSP-HOR-14-726 (ají dulce y de semillas picantes), OSP-HOR-19-1047 y OSP-HOR-19-1046 (ají picante). El Grupo II y distancia 0,23: OSP-HOR-10-991, OSP-HOR-14-727, OSP-HOR-10-989, OSP-HOR-10-995, OSP-HOR-11-479 y OSP-HOR-12-1048 (ajíes dulces). Las coordenadas 1 y 2 del ACP explicaron el 44,88% de la variabilidad acumulada. Se evidenció la formación de un grupo adicional al mostrado en el dendrograma, sólo con la accesión OSP-HOR-19-1046 (picante y de otra especie del género Capsicum). El análisis molecular reflejó una variabilidad genética y separó los materiales de ajíes en grupos discriminantes, asociadas posiblemente con la presencia/ausencia de pungencia en las accesiones

ABSTRACT

The high genetic variability existing in sweet pepper makes it necessary to obtain homogeneous material, both agronomic and culinary, and molecular characterization facilitates the study of genetic diversity between materials that can be included in genetic improvement programs. The objective of the present study was molecularly characterized 12 pepper accessions from the INIA-CENIAP germplasm bank, using 12 RAPD markers. Leaf tissue was used for DNA extraction, and PCR-RAPD products were separated on 1.5% agarose gels. The best resolution for assessing genetic variability and polymorphism among accessions was observed with primers OPA 02, OPE 03 and OPE 04. 39 fragments were generated, of which 27 were polymorphic (69,23%). The presence-absence matrix allowed calculating the polymorphism percentage, PIC, multivariate cluster analysis UPGMA (dendrogram), using Jaccard distance. The similarity values among the studied genotypes range from 0.00 to 0.77. OPE 03 provided the highest polymorphic information (78.57%) and PIC=0.34. The UPGMA analysis generated two discriminant groups, Group I and similarity distance of 0.20; the accessions: OSP-HOR-10-988, OSP-HOR-10-399, OSP-HOR-14-981 (sweet peppers), OSP-HOR-14-726 (sweet and hot seed peppers), OSP-HOR-19-1047 and OSP-HOR-19-1046 (hot peppers). Group II and distance 0.23: OSP-HOR-10-991, OSP-HOR-14-727, OSP-HOR-10-989, OSP-HOR-10-995, OSP-HOR-11-479 and OSP-HOR-12-1048 (all sweet peppers). PCA coordinates 1 and 2 explained 44.88% of the accumulated variability. The formation of an additional group to that shown in the dendrogram was evident only with the accession OSP-HOR-19-1046 (hot and from another species of the Capsicum genus). Molecular analysis reflected genetic variability and separated the chili pepper materials into distinct groups, possibly associated with the presence/absence of pungency in the accessions.