Extensión de un Constructor Molecular para Química Computacional

Abstract

La química computacional es una rama de la química que utiliza principios de la computación para resolver problemas químicos. La solución de problemas químicos ha beneficiado al hombre con la creación de productos que mejoran su calidad de vida. Para facilitar el estudio de la gran variedad de componentes en el universo y para no poner en peligro en algunos casos a los investigadores, la química computacional realiza cálculos sobre los modelos digitales de las moléculas de esos componentes, generados por sistemas interactivos llamados constructores moleculares. A medida que los modelos de moléculas han sido más fáciles de construir, los problemas químicos se han resuelto en menos tiempo, mejorando la calidad de vida del hombre más rápidamente. Hoy en día existen institutos de investigación dedicados a resolver una gran variedad de problemas relacionados con la química computacional en el menor tiempo posible, desarrollando herramientas cada vez más avanzadas. Tal es el caso del IVIC (Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas). El Laboratorio de Química Computacional del IVIC genera con regularidad modelos digitales de moléculas para ser utilizados por programas de cálculo, por lo cual está buscando constantemente constructores moleculares cada vez más fáciles de aprender a utilizar que le permitan generar los modelos de una manera más eficiente. Este trabajo presenta el desarrollo de Jmol Builder, una versión de Jmol con un constructor más complejo e intuitivo, accesible vía web, de código abierto, de fácil extensión y respaldado por una activa comunidad de desarrolladores, que contiene una amplia gama de funcionalidades útiles para el químico computacional. Fue desarrollado para ser un componente fundamental de una plataforma integradora web para química computacional llamada IVIChem. La utilidad de Jmol Builder es demostrada con muy buenos resultados a partir de una serie de encuestas basadas en la escala de Likert respondidas por investigadores del IVIC. Además, la aplicación es conocida y apoyada por la comunidad de desarrolladores de Jmol.