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Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/123456789/7530

Título : Caracterización de la diversidad genética del cerdo criollo venezolano presente en los Edos. Apure, Barinas y Guárico, utilizando marcadores microsatélites
Autor : Galíndez González, Rafael
Palabras clave : alelos
distancia genética
endocría
structure
variabilidad genética
alleles
genetic distance
genetic variability
inbreeding
structure
Fecha de publicación : 3-Nov-2014
Citación : 2014;1387-003
Resumen : Con el objetivo de caracterizar la diversidad genética del cerdo Criollo venezolano presente en los estados Apure, Barinas y Guárico, utilizando marcadores microsatélites, se analizaron muestras de ADN de folículos pilosos o sangre de 22 individuos de Masaguaral, 26 El Socorro, 31 Guayabal, 31 Arismendi, 29 Capanaparo, 32 Cunaviche, 29 alentejanos, 30 ibéricos, 21 Landrace y 14 Large White. Se analizaron en el Laboratorio de Genética Molecular del Centro de Investigaciones en Biotecnología Agrícola en el Instituto de Genética de la Facultad de Agronomía de la Universidad Central de Venezuela. Se amplificaron 14 marcadores microsatélites por la técnica de PCR y se tipificaron los fragmentos mediante tinción con plata. Se calculó el número de alelos, frecuencias alélicas, contenido de información polimórfica, las heterocigosidades, equilibrio Hardy – Weinberg, probabilidad de exclusión, distancias genéticas, árboles filogenéticos, estadísticos “F”, índice de Nei y análisis de la estructura de las poblaciones. El número de alelos por locus se ubicó entre 3,31 (alentejano) y 4,15 (Masaguaral) para un total de 63 alelos. Con excepción del marcador SW122 los demás loci resultaron polimórficos. Los alelos 155, 165 y 171 (S0225) están privados en la raza Landrace; el alelo 240 (S0227) está privado en la población de Arismendi; mientras que el alelo 219 está solo en los cerdos Criollos venezolanos. Las heterocigosidades y el índice de contenido polimórfico se ubicaron en el rango de 0,408 – 0,609, siendo la heterocigosidad esperada generalmente superior a la observada. Dentro de las poblaciones los marcadores en desequilibrio variaron entre dos (Masaguaral y Guayabal) y siete (Large White). La probabilidad de exclusión por población usando un panel de 10 marcadores se ubicó en valores superiores al 99%. Se observó moderada diferenciación genética (FST = 12,5%; GST = 13,6%) y un ligero aumento de homocigosis en algunas poblaciones (FIS = 0,034 – 0,167). Las distancias genéticas revelaron que los grupos más cercanos son El Socorro y Arismendi y estos a su vez muy cercanos a las razas comerciales. Los cerdos de Capanaparo y Guayabal se separan en un grupo distinto; mientras que los cerdos de Cunaviche se aproximan a los cerdos de la Península Ibérica. El análisis de agrupamiento utilizando las distintas metodologías corroboró la agrupación descrita, considerándose al final la existencia de seis clúster bien diferenciados. Se concluye que existe variabilidad genética dentro y entre los cerdos Criollos venezolanos y representan grupos definidos que justifican aplicar planes de conservación, multiplicación y mejora genética.
Descripción : In order to characterized the Venezuelan Creole pig genetics diversity at Apure, Barinas and Guárico state, using microsatélites markers, were analyzed AND of hairless follicles or blood of 22 individual of Masaguaral, 26 of El Socorro, 31 Guayabal, 31 Arismendi, 29 Capanaparo, 32 Cunaviche, 29 Alentejanos, 30 Iberian, 21 Landrace and 14 Large White. They were analyzed in the Centro de Investigaciones en Biotecnología Agrícola, Instituto de Genética de la Facultad de Agronomía de la Universidad Central de Venezuela. 14 microsatellites markers were amplified for PCR technique and were typified with silver staining. Was calculated the alleles numbers, allelic frequency, polymorphic information content, heterozygosities, Hardy – Weinberg equilibrium, exclusion probability, genetics distances, phylogenetic trees, “F” statistics, Nei index and population structure analyses. Allele number by locus was between 3.31 (Alentejano) and 4.15 (Masaguaral) for 63 total alleles. With the exception SW122 marker the other loci were polymorphic. The 155, 165 and 171 (S0225) alleles are private in Arismendi; however, 219 allele is only in Venezuelan Creole pigs. The heterozygosities and polymorphic content index were in 0.408 – 0.609 range, being expected heterozygosities higher than observed. Within populations the disequilibrium ranges between two markers (Masaguaral and Guayabal) and seven (Large White). Exclusion probability by population using 10 markers was greater than 99%. Moderated genetic differentiation was observed (FST = 12.5%; GST = 13.6%) and sligth increase in homozygosis in some populations (FIS = 0.034 – 0.167). Genetics distances revealed that that the closest groups are El Socorro and Arismendi and this are near commercial breeds. Capanaparo and Guayabal pigs are separate into a distinct group; while Cunaviche pigs are near to Iberian Peninsula pigs. The cluster analysis using different methodologies corroborated the grouping described, whereas in the end the existence of six distinct cluster. It is concluded that there is genetic variability within and between the Venezuelan Creole pigs and represent defined groups that justify implementation of plans for the conservation, multiplication and genetic improvement.
URI : http://saber.ucv.ve/jspui/handle/123456789/7530
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